Przed gastroskopią nie powinno się przez 6 godzin jeść i przez 4 godziny pić. W przypadku zaburzeń opróżniania żołądka dłużej (np. gastropatia cukrzycowa, inne zaburzenia motoryki).

Bezpośrednio przed gastroskopią trzeba wyjąć ewentualnie posiadane protezy zębowe.